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  • 香菇基因組中L-半胱氨酸亞砜裂解酶同源蛋白的生物信息學(xué)分析


    【發(fā)布日期】:2019-01-26  【來(lái)源】:菌物學(xué)報(bào)
    【作者】王瑩 鮑大鵬 楊瑞恒 陳洪雨 高英女 李燕 茅文俊 吳瑩瑩
    【機(jī)構(gòu)】國(guó)家食用菌工程技術(shù)研究中心農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所
    摘要:L-半胱氨酸亞砜裂解酶(L-cysteine sulfoxide lyase,C-S lyase)是香菇中含硫風(fēng)味物質(zhì)生物合成途徑的關(guān)鍵酶之一。本文基于6個(gè)不同香菇菌株的全基因組測(cè)序數(shù)據(jù),挖掘了24個(gè)潛在的香菇L-半胱氨酸亞砜裂解酶(LentinulaedodesC-Slyase,Lecsl)同源基因,對(duì)其編碼蛋白的生理生化特性、信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、轉(zhuǎn)錄活性、分子進(jìn)化、保守基序和蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)等方面進(jìn)行了分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),這24個(gè)香菇Lecsl同源蛋白含有相同的蛋白結(jié)構(gòu)域(IPR015424和IPR000192),都屬于L-半胱氨酸脫巰基酶家族(PTHR43092:SF2),都不含信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu),但它們的蛋白穩(wěn)定性有所不同。對(duì)24個(gè)Lecsl同源蛋白進(jìn)行聚類(lèi)分析發(fā)現(xiàn),其中的11個(gè)組成了新的進(jìn)化分支,這一分支的Lecsl同源蛋白在香菇的菌絲體或子實(shí)體中有轉(zhuǎn)錄活性,且含有蒜酶和L-半胱氨酸脫硫酶的保守基序19,推測(cè)這一分支的Lecsl同源蛋白在香菇中具有催化產(chǎn)生含硫風(fēng)味物質(zhì)和內(nèi)源性甲醛的活性。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),這一分支又分為兩個(gè)亞支,其中一支包含已發(fā)現(xiàn)的Lecsl/LE01_CSL1,并且在香... 更多
     
    基金:上海市科委科技創(chuàng)新行動(dòng)計(jì)劃(17391900400); 上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字(2016)第6-1-3號(hào)]; 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院卓越團(tuán)隊(duì)建設(shè)計(jì)劃[農(nóng)科創(chuàng)2017(A-02)]~~;
     
    關(guān)鍵詞:香菇; L-半胱氨酸亞砜裂解酶; 生物信息學(xué); 聚類(lèi)分析; 關(guān)鍵氨基酸;
     
     
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