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    重慶師范大學杜習慧團隊在羊肚菌屬基因組的微衛(wèi)星(SSR)挖掘、種質(zhì)資源評價和品種鑒定方面取得新進展


    【發(fā)布日期】:2019-05-13  【來源】:易菇網(wǎng)
    【核心提示】:篩選出合適的分子標記對我國目前主栽培品種構建DNA 指紋圖譜和遺傳多樣性分析,對羊肚菌栽培品種的準確鑒定、知識產(chǎn)權的保護和新品種選育具有重要指導意義。
      作為我國食用菌行業(yè)近幾年異軍突起的一類真菌,羊肚菌在國內(nèi)備受關注,隸屬于羊肚菌屬(Morchella),包括黑色羊肚菌、黃色羊肚菌和變紅羊肚菌三大類。其中,黑色羊肚菌部分物種的成功栽培,使羊肚菌的人工種植自 2012 年起在國內(nèi)迅速擴張,幾乎各地均有栽培。由于羊肚菌菌種市場長期存在菌種雜亂的現(xiàn)象,菌種名稱混亂且質(zhì)量參差不齊,損害了育種者的積極性和菇農(nóng)的利益。因此,篩選出合適的分子標記對我國目前主栽培品種構建DNA 指紋圖譜和遺傳多樣性分析,對羊肚菌栽培品種的準確鑒定、知識產(chǎn)權的保護和新品種選育具有重要指導意義。
      近日,重慶師范大學杜習慧老師團隊以國內(nèi)主要羊肚菌栽培物種梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、頭絲羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 為研究對象,以各物種的野生樣品和不同栽培品種樣品為研究材料,基于梯棱羊肚菌基因組序列,開展研究并得到以下結果:1)首次對梯棱羊肚菌基因組內(nèi) SSR 的分布和構成進行了分析,結果顯示梯棱羊肚菌基因組內(nèi)有 12902 個 SSR 位點構成,其中單核苷酸單元重復的 SSR 最多(66.2%),其次分別是三核苷酸(15.4%)、二核苷酸(12.1%)、四核苷酸(3.7%)、五核苷酸(1.3%)和六核苷酸(1.3%)單元重復;2)篩選出 180 對 SSR引物對上述六個物種的 24 份代表樣品進行初步分析,發(fā)現(xiàn) SSR 在這些物種間具有很高的轉移率(87.7%),位點的擴增成功率與物種間的親緣關系成正比;3)進而篩選出22對SSR引物對上述六個物種的127份樣品進行深入分析,結果顯示22個SSR位點在各物種內(nèi)部具有較高的遺傳多樣性,同時檢測到這些物種間具有雜交現(xiàn)象,并證實所使用的91個栽培樣品均為不同的品種,具有不同的基因型,菇農(nóng)所使用的菌種名稱混亂,同物異名異物同名現(xiàn)象嚴重。以上研究結果在羊肚菌菌種遺傳多樣性分析、菌種鑒定、品種選育和知識產(chǎn)權保護等方面具有重要的應用價值。
      目前,該研究成果以“Hybridization, characterization and transferability of SSRs in thegenus Morchella ” 為 題 在 線 發(fā) 表 于 Fungal Biology 上 。 文 章 鏈 接 :https://doi.org/10.1016/j.funbio.2019.05.005
    QQ截圖20190513162515
    Fig. 1 基于 SSR 標記對 127 份羊肚菌樣品的群體結構分析、主成分分析和 UPGMA 聚類圖
    QQ截圖20190513162601
    Fig. 2 梯棱羊肚菌(M. importuna)、六妹羊肚菌(M. sextelata)、七妹羊肚菌(M. eximia)、頭絲羊肚菌(M. exuberans)、Mel-13 和 Mel-21 的群體結構分析和主成分分析
    QQ截圖20190513162653
    Fig. 3 SSR 位點擴增失敗率與物種間的親緣關系
     
     
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