研究人員從普渡大學(xué)（Purdue University）和英國皇家植物園（the Royal Botanic Gardens）搜集真菌，然后從中提取遺傳物質(zhì)，幫助了一組研究人員繪制出了蘑菇的生命之樹圖譜，這幅圖譜展現(xiàn)了幾種重要的蘑菇種類之間的關(guān)系，拼湊出了它們完整的進(jìn)化歷史，這正是科學(xué)家們在過去的200多年里一直奮力研究的難題。
研究小組使用了冷凍、加熱干燥、冷凍干燥的方法處理了標(biāo)本，然后從中提取DNA來分析39個(gè)基因組的數(shù)據(jù)，這39個(gè)基因組代表了大部分常見的傘菌目（ah-gehr-ah-KAY-leez），它們囊括了我們最熟悉的一些蘑菇綱目，其中包括可培植食用蘑菇、致幻蘑菇和致命蘑菇。高通量測序技術(shù)幫助科學(xué)家確定了七個(gè)新亞目和傘菌目的主干，為驗(yàn)證蘑菇的進(jìn)化假說提供了框架。
真菌學(xué)副教授Catherine Aime說：真菌學(xué)真的是生物學(xué)中最新的研究領(lǐng)域之一，我們知道真菌的種類是植物的6到20倍以上，但我們對真菌的了解卻很少。從林奈（Carl von Linn，18世紀(jì)瑞典著名博物學(xué)家）開始人們就一直試圖弄清楚各種蘑菇之間的關(guān)系。現(xiàn)在終于這個(gè)謎團(tuán)終于被解開，這著實(shí)是一件讓人興奮的事。
真菌對于生態(tài)系統(tǒng)、植物和動(dòng)物的健康必不可少。它們可以使倒木等有機(jī)物腐壞，分解物質(zhì)并釋放養(yǎng)分供給其他生物體。大多數(shù)陸生植物依靠有益真菌來傳輸水分和其他營養(yǎng)，并且牛等反芻動(dòng)物的腸道真菌在消化過程中起到了至關(guān)重要的作用。大多數(shù)人體中也寄存著真菌，這有助于維護(hù)我們的自然植物群的平衡。
盡管真菌如此重要且種類豐富，然而我們卻對真菌所知甚少。Aime說，許多真菌物種都有著神秘莫測的生活史，因此給研究帶來了不小的困難。絕大多數(shù)真菌都很微小，只有少數(shù)綱目的蘑菇是肉眼可見的。有些真菌生命周期復(fù)雜，與其他多細(xì)胞有機(jī)體無法類比。還有一些真菌極為罕見，關(guān)于它們的記錄很少，有些用常規(guī)方法根本檢測不到。
Aime說，真菌的神秘正是現(xiàn)在保存的真菌標(biāo)本（fungaria）如此寶貴的原因之一。這些標(biāo)本為已知真菌的多樣性提供了全景圖，常常是稀有物種唯一可研究的領(lǐng)域。
她還說道：要想到大自然中重新搜集其中的很多標(biāo)本，即便不花上有生之年，也將耗費(fèi)數(shù)十年光景。
以前，由于基因組測序技術(shù)非常復(fù)雜，以及從年久、干燥的標(biāo)本中獲取DNA的質(zhì)量較差，因此真菌標(biāo)本在基因研究中發(fā)揮的作用有限。這一狀況在最近幾年才得以改善。隨著科技的進(jìn)步，Aime和她的同事們得以使用從普渡大學(xué)和英國皇家植物園采集而來的真菌標(biāo)本中提取出的短DNA序列，組成完整的基因組，并且找到了充當(dāng)鏈接相近蘑菇種類的標(biāo)記基因，最終完成了生命之樹圖譜。
這一圖譜提供了迄今最清晰、最詳細(xì)的闡述，說明了蘑菇之間的基本關(guān)系以及某些蘑菇是在何時(shí)進(jìn)化產(chǎn)生的。Aime說，根據(jù)生命之樹的描繪，最早的傘菌目是分解物或活體寄生物，其類別包括病原體，它們從其他有機(jī)體中獲得所需營養(yǎng)。
Aime 說：我們產(chǎn)生了這樣的觀點(diǎn)，那就是生物體隨著進(jìn)化會(huì)變得更自私，它們在演變成病原體的過程中學(xué)會(huì)了如何利用生存系統(tǒng)。但這種自私癥狀可能僅僅出現(xiàn)在早期，隨著時(shí)間的推移，一些物種會(huì)共同進(jìn)化，最后變得更加能夠互惠共生。
Aime還說，這項(xiàng)研究還強(qiáng)調(diào)了真菌標(biāo)本作為基因時(shí)代的科研資源的重要性。
她還說道：我們可能正處在一個(gè)重要的收藏品革命的前夜，人們認(rèn)為真菌標(biāo)本類似于郵票藏品，但實(shí)際并不是這樣的。這些標(biāo)本是我們得出所有生物學(xué)觀點(diǎn)的依據(jù)，對于一些瀕?；蚩赡芤呀?jīng)滅絕的物種來說，它們更像是我們唯一的資源庫。我們收集和保存盡可能多的物種是格外重要的。未來的技術(shù)可能讓我們有辦法使用這些保存的標(biāo)本，其方式是我們現(xiàn)在無法想象的。我們必須在物種消失前將它們保存起來。
