1.雜菌污染  
　?。保┚G霉：綠霉是平菇栽培中危害最嚴(yán)重的一種雜菌。
　　原因：培養(yǎng)料質(zhì)量差；含水量高；培養(yǎng)溫度高；菌種質(zhì)量差。
　　辦法：選用優(yōu)質(zhì)培養(yǎng)料；含水量適宜；適溫養(yǎng)菌；選用抗逆性強(qiáng)、適齡的優(yōu)質(zhì)菌種。出現(xiàn)綠霉后將菌袋搬到室外低溫發(fā)菌即可。
　　２）鬼傘 ：是高溫期容易大量發(fā)生的一種競(jìng)爭(zhēng)性雜菌。
　　原因：培養(yǎng)料質(zhì)量差；pH值偏低；氨氣濃度高；培養(yǎng)溫度高。
　　辦法：選用優(yōu)質(zhì)培養(yǎng)料；調(diào)高pH值；減少尿素用量；發(fā)酵徹底；避免高溫危害?！　〕霈F(xiàn)鬼傘時(shí)，應(yīng)盡隔袋早將之?dāng)D爛并散堆降溫。
　　2.發(fā)酵時(shí)不升溫  
　　原因：料經(jīng)過雨淋；料太粗；料太干或太濕；堆太小。
　　辦法：料顆粒度適宜，顆粒、粉末各占50%最好；含水量適中；料堆適當(dāng)加大；溫度低時(shí)覆蓋草簾。 
　　3.不發(fā)菌 
　　原因：菌種老化；氨氣濃；燒菌。
　　辦法：選用適齡優(yōu)質(zhì)菌種；減少化肥用量；發(fā)酵結(jié)束后，料溫冷卻至30℃以下才能開始接種；養(yǎng)菌溫度不超過28℃。
　　4.不出菇
　　原因：菌齡偏短，未達(dá)生理成熟；無(wú)溫差或溫差??；料面太干；菌種溫型不對(duì)。
　　適時(shí)解口出菇；拉大溫差；解口后立即增加濕度。低溫種高溫下不出菇。 
　　 5.畸形菇 
　　（１）長(zhǎng)腿菇：
　　原因：二氧化碳濃度高；品種不對(duì)路；光線太弱。
　　辦法：加強(qiáng)通風(fēng)換氣；選擇對(duì)路品種，中溫種低溫下長(zhǎng)成長(zhǎng)腿菇；增加光照。
　　（２）藍(lán)（紫）色菇 ：
　　原因：一氧化碳濃度高，煤氣中毒。
　　辦法：加強(qiáng)通風(fēng)換氣，用煤爐加熱時(shí)需安排氣筒。 
　　 6.菇蕾死亡 
　　原因：菇蕾期噴水過重；高溫高濕；通風(fēng)不良；害蟲危害。
　　辦法：在菇蕾生長(zhǎng)期嚴(yán)禁向菇上噴水；不打關(guān)門水；防止高溫悶棚，防治害蟲。 
　　總之，栽培平菇應(yīng)當(dāng)根據(jù)其生物學(xué)特性進(jìn)行管理，要想獲得優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)，必須選用優(yōu)質(zhì)菌種，培養(yǎng)料含水量不能偏高，培養(yǎng)溫度不宜偏高。