日前，中國(guó)科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳課題組首次把真菌的演化時(shí)間應(yīng)用于確定分類(lèi)等級(jí)和分類(lèi)系統(tǒng)重建工作中，制定了演化時(shí)間作為確定分類(lèi)等級(jí)的一個(gè)新標(biāo)準(zhǔn)。她說(shuō)：“在劃分單系類(lèi)群的分類(lèi)等級(jí)時(shí)，相同分類(lèi)等級(jí)的演化時(shí)間應(yīng)大體一致；高分類(lèi)等級(jí)的演化時(shí)間要早于低分類(lèi)等級(jí)的原則。”相關(guān)論文已發(fā)表于真菌學(xué)領(lǐng)域的權(quán)威期刊。

　　趙瑞琳介紹了該研究思路首先在種類(lèi)及進(jìn)化支序繁多的蘑菇屬上應(yīng)用，具體工作為：在700余世界各地樣品初步的系統(tǒng)發(fā)育分析的基礎(chǔ)上，以?xún)蓚€(gè)傘菌綱化石標(biāo)本為演化時(shí)間校訂點(diǎn)，通過(guò)多基因序列的分子鐘分析，確定蘑菇屬演化形成于6600萬(wàn)年前；在3000萬(wàn)年前形成6個(gè)單系支序（被命名為亞屬）；在2000萬(wàn)年前左右，進(jìn)一步分化出的22個(gè)單系支序（被命名為組）；而其他單系支序由于形成時(shí)間明顯晚于上述時(shí)間，不被劃分為任何一個(gè)種上分類(lèi)單元，最終重建了蘑菇屬的世界性分類(lèi)體系，解決了蘑菇屬內(nèi)大量新進(jìn)化分支的命名分類(lèi)難點(diǎn)。

　　趙瑞琳說(shuō)：“我們首先集結(jié)近十年來(lái)?yè)?dān)子菌門(mén)的最新進(jìn)展，分別構(gòu)建了擔(dān)子菌門(mén)6個(gè)基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜，及基于396個(gè)直系同源基因的系統(tǒng)發(fā)育圖譜。”

　　隨后的分子鐘分析表明擔(dān)子菌門(mén)演化形成于5.3億年前，擔(dān)子菌門(mén)中4個(gè)亞門(mén)的演化時(shí)間為4億~4.9億年前，對(duì)于具有大型子實(shí)體的傘菌綱的演化時(shí)間范圍分別為3.4億~3.9億年前，具有較小子實(shí)體的銹菌亞門(mén)和黑粉菌亞門(mén)中綱的演化時(shí)間范圍分別為2.4億~3.4億年前；擔(dān)子菌門(mén)中各個(gè)目的演化時(shí)間為1.2億~2.9億年前。

　　因此，趙瑞琳建議把這些演化時(shí)間作為建立擔(dān)子菌門(mén)中目及目以上分類(lèi)等級(jí)的一個(gè)依據(jù)。借助于演化時(shí)間這一新標(biāo)準(zhǔn)，還新認(rèn)定一個(gè)亞門(mén)Wallemiomycotina；發(fā)現(xiàn)1個(gè)目由于過(guò)于年輕的演化時(shí)間建議廢除；2個(gè)科由于具有的古老演化時(shí)間，分別正式提升為2個(gè)目。

　　趙瑞琳課題組的研究表明，演化時(shí)間可以成為劃分真菌分類(lèi)等級(jí)的一個(gè)新標(biāo)準(zhǔn)，而且給出了擔(dān)子菌門(mén)劃分亞門(mén)、綱、亞綱和目的演化時(shí)間范圍標(biāo)準(zhǔn)。此研究方法為解決大量發(fā)現(xiàn)的新進(jìn)化支序的合理分類(lèi)問(wèn)題，制定更客觀和穩(wěn)定的分類(lèi)系統(tǒng)提供新的依據(jù)，目前已在其他類(lèi)群（如子囊菌門(mén)，表生真菌等）的系統(tǒng)學(xué)研究中采用。