【作者】李闖劉娜王鑫許笑蒙申一林邢國珍康振生鄭文明

【機構】河南農業(yè)大學生命科學學院小麥玉米作物學國家重點實驗室河南糧食作物協同創(chuàng)新中心西北農林科技大學植物保護學院旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室

摘要：本研究利用已測序的條形柄銹菌Puccinia striiformis f.sp.tritici基因組序列信息,結合已公布的隱匿柄銹菌Puccinia recondita f.sp.tritici和禾柄銹菌Puccinia graminis f.sp.tritici全基因組編碼蛋白序列,運用生物信息數據庫和分析軟件對其碳水化合物酶類(CAZymes)基因家族進行了注釋和比較分析。結果表明,3種小麥銹菌共包含1 232個CAZymes編碼基因(含有1 279個模塊)。其中,條形柄銹菌具有明顯較大的CAZymes家族,3種銹菌的CAZymes具有136個同源基因;相對于隱匿柄銹菌和禾柄銹菌,條形柄銹菌的GH、GT和AA家族發(fā)生顯著擴增,而3種銹菌的PL家族并無差異;CBM家族則表現為由禾柄銹菌、隱匿柄銹菌到條形柄銹菌的遞增式擴增。通過CAZymes、細胞壁降解酶、分泌蛋白、PHI、保守基序等不同形式注釋的比較分析表明,對該基因家族而言,條形柄銹菌相對于隱匿柄銹菌和禾柄銹菌呈擴增現象,隱匿柄銹菌和禾柄銹菌的家族縮減水平存在差異。小麥銹菌CAZymes家族整體呈現的不同形式擴增或縮減現象,可能反... 更多

 

基金：國家重點基礎研究發(fā)展計劃(2013CB127702)； 河南省科技創(chuàng)新杰出人才計劃(154200510024)； 河南省重大科技專項(161100110400)~~；

 

關鍵詞：小麥銹菌; 碳水化合物酶類; 基因家族; 生物信息學分析; 致病性變異;