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    草菇α-淀粉酶基因的生物信息學(xué)分析


    【發(fā)布日期】:2016-03-09
    【作者】 杜慕云; 楊仁德; 李劍; 謝寶貴; 
     
    【Author】 DU Muyun;YANG Rende;LI Jian;XIE Baogui;Guizhou Soil and Fertilizer Institute;Mycological Research Center of Fujian Agricultural and Forestry University;
     
    【機(jī)構(gòu)】 貴州省土壤肥料研究所; 福建農(nóng)林大學(xué)菌物研究中心; 
     
    【摘要】 基于草菇(Volvariella volvacea)基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學(xué)的方法對草菇α-淀粉酶基因進(jìn)行基本理化性質(zhì)、內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)、信號肽、亞細(xì)胞定位和功能位點(diǎn)的預(yù)測與分析,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明:編碼草菇α-淀粉酶的基因有5個,分別為GME2151、GME6695、GME9075、GME10698和GME10705;5個基因編碼的蛋白相對分子量介于38.8~64.6kD之間,磷酸化以Ser位點(diǎn)為主,大都存在信號肽,亞細(xì)胞定位在細(xì)胞外,保守結(jié)構(gòu)域和空間結(jié)構(gòu)相似度較高。和其它的擔(dān)子菌一樣,草菇α-淀粉酶可以分為兩類:GME9075和GME10698歸為α-淀粉酶Ⅰ類,GME2151、GME6695和GME10705屬于α-淀粉酶Ⅱ類。 更多還原
     
    【關(guān)鍵詞】 草菇; α-淀粉酶基因; 生物信息學(xué); 
    【文內(nèi)圖片】
    【基金】 草菇育種崗位(編號:CARS 24);黔科合體(編號:Z字2013-4006號)的部分研究內(nèi)容
     
     
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