【作者】龔明 鮑大鵬 唐傳紅 張勁松
【機(jī)構(gòu)】上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所農(nóng)業(yè)部 南方食用菌資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國家食用菌工程技術(shù)研究中心 國家食用菌加工技術(shù)研發(fā)中心 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室
摘要：對(duì)"滬靈芝"(Ganoderma lucidum SH)等23個(gè)真菌物種進(jìn)行全基因組系統(tǒng)發(fā)生分析,進(jìn)一步選取其中具有代表性的物種進(jìn)行比較基因組學(xué)分析。全基因組系統(tǒng)發(fā)生分析和分子鐘估計(jì)結(jié)果顯示,滬靈芝分化時(shí)間(8.75百萬年前)明顯晚于靈芝屬分化時(shí)間(180百萬年前);基因家族尺寸和直系同源基因數(shù)目分析顯示,與另外參試靈芝菌種相比滬靈芝基因家族具有一定的收縮趨勢(shì);進(jìn)一步對(duì)基因家族數(shù)目進(jìn)行比較的結(jié)果顯示,滬靈芝逆轉(zhuǎn)錄酶家族發(fā)生了顯著擴(kuò)增。GO功能分析提示滬靈芝逆轉(zhuǎn)錄酶家族的功能富集主要為核酸結(jié)合功能和酶的催化活性。
基金：上海市農(nóng)科發(fā)2013(10)； 上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字(2014)第7-1-7號(hào)]； 國家自然科學(xué)基金(31401933)資助；
關(guān)鍵詞：靈芝; 全基因組分析; 分子鐘; 基因擴(kuò)增; GO功能分析;