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    不加權組平均法在云南山地小型真菌生物多樣性研究中的應用


    【發(fā)布日期】:2018-02-02  【來源】:菌物學報
    【作者】李文鵬 周應揆 李明春 邢來君
    【機構】南開大學微生物系 云南大學工業(yè)微生物發(fā)酵工程重點實驗室 南開大學微生物系 天津300071云南大學工業(yè)微生物發(fā)酵工程重點實驗室昆明650091天津300071
    【摘要】通過RAPD分析對38個不同寄主來源的彎孢類炭疽菌菌株的系統(tǒng)發(fā)育及分類進行研究。結果表明:許多引物的RAPD擴增帶型在種內(nèi)是相似或一致的,而種間差異較大。UPGMA聚類分析的結果表明:38個彎孢類炭疽菌菌株被聚為6個類群,群內(nèi)菌株之間遺傳相似性較高,而群間遺傳相似性較低;群與群之間分界明顯,表明種的分界相當明顯。因此,RAPD分析所反映的種間親緣關系,將有助于疑難種分類地位的確定和近似種的區(qū)分。RAPD分析的結果還揭示了一些近似種的分類關系,如按傳統(tǒng)方法分別鑒定為Colletotrichumtruncatum、C.circinans和辣椒炭疽菌C.capsici的許多菌株聚類在同一群內(nèi),有很高的遺傳相似性,實驗結果支持它們?yōu)橥粋€種。實驗中還發(fā)現(xiàn)5條辣椒炭疽菌的特有片斷,分別由引物OPE-14、OPH-15(2條)、OPM-12和OPM-20擴增產(chǎn)生。這些特異帶的發(fā)現(xiàn)對該菌的快速檢測和鑒定具有重要意義。 
    【基金】國家自然科學基金項目(3870062);
    【關鍵詞】山地生態(tài)系統(tǒng); 熱帶; 亞熱帶; 香農(nóng)指數(shù);
     
     
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